hdf5数据库的并行读写，是怎么回事?

一、hdf5数据库的并行读写是怎么回事

关键点在于告知数据位置（hyperslab）。比如说我要把我100*100的矩阵分成10*10的block，我需要告诉代码我的分配规则。比如说，rank0 写在名列前茅行名列前茅列，rank1写在名列前茅行第二列，我就可以写col=rank%10，row=rank／10，（从0计数），写的时候每个processor会告知，mydata，myrank，myposition，然后并行的时候每个核的数据就会被写在相应的位置。

给个fortran的例子，

CALL h5sselect_hyperslab_f (filespace, H5S_SELECT_SET_F, offset, count, error, stride,block_size)

这里filespace 告知在文件里开辟的内存id，第二个内置参数，告诉怎样写，后面offset，count，stride，block什么的全都用于描述位置，你可以横着写，数着写，跳着写，转着圈写。。。一般我只用两个参数就能描述清楚了，因为我搞的是结构网格，一开始还不理解为什么那么多种写数据的花型。直到后面写作业用到非结构网格，这个时候描述数据位置就尤其重要了，因为你需要让相邻processor处理的数据物理空间也尽量靠近，这样才能减少block之间的信息交互，然后提高计算速度。

延伸阅读：

二、并发锁

在一定条件下，MyISAM也支持查询和操作的并发进行。
MyISAM存储引擎有一个系统变量concurrent_insert，专门用以控制其并发插入的行为，其值分别可以为0、1或2。
当concurrent_insert设置为0时，不允许并发插入。
当concurrent_insert设置为1时，如果MyISAM允许在一个读表的同时，另一个进程从表尾插入记录。这也是MySQL的默认设置。
当concurrent_insert设置为2时，无论MyISAM表中有没有空洞，都允许在表尾插入记录，都允许在表尾并发插入记录。
可以利用MyISAM存储引擎的并发插入特性，来解决应用中对同一表查询和插入锁争用。例如，将concurrent_insert系统变量为2，总是允许并发插入；同时，通过定期在系统空闲时段执行OPTIONMIZE TABLE语句来整理空间碎片，收到因删除记录而产生的中间空洞。